土地被占用每年每亩收1000元流转费合法吗

土地被占用收流转费需依法确定。依据《土地管理法》，有偿使用土地应缴出让金，非法占用或未按规定缴费可能面临法律处罚，严重影响土地权益。
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土地被占用收费不合法。操作：1. 与占用方沟通，要求出示合法依据；2. 若无法解决，咨询律师，准备证据提起诉讼；3. 同时可向土地管理部门反映情况，请求查处非法行为。
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处理土地被占用收流转费问题，常见方式有协商、诉讼或举报。应先尝试与占用方协商，协商不成可通过法律途径诉讼，或向土地管理部门举报非法占用。